增進腸內益菌的生長，大約每1克的腸內容物中，有多達1兆個細菌。
菊糖在腸道中會被細菌的酵素分解成「乳酸與短鏈脂肪酸」。可以增進體內益菌—「雙歧桿菌」的生長，當益菌數量多的時候，害菌自然就少，代表身體健康。
菊糖會降低腸道的「酸鹼度」，使腸道不利害菌的生長。而害菌「產氣夾膜梭菌」沒有利用菊糖的能力。所以持續攝取菊糖兩周後，益菌就漸漸地變成腸道數量最多的優勢菌種了，連壞菌「梭菌及細梭菌」也顯著地減少。
抑制腸道發炎，這些益生菌會與腸系的「淋巴組織」接觸，抑制腸道發炎。
抑制「腸癌細胞」的增殖，而其中有一種短鏈脂肪酸「丁酸」許多研究都發現它可以抑制「腸癌細胞」的增殖，刺激癌細胞分化及誘導腸癌細胞凋亡。
菊糖可以促進腸道蠕動，縮短糞便通過腸道的時間，所以有助於便秘與宿便的改善，便秘兩天內立刻解決。(1天2次排便才算正常：髒東西不留隔天避免大腸癌) 連青春痘都會好！
菊糖可以吸附「殘渣廢物」，幫助人體迅速排出體外，進而減少致癌物質對腸壁的刺激，能降低便祕、腸癌和大腸病變的機會。（皮膚好、便便不臭）
免毒素吸收，有助直腸癌的預防，食物消化吸收後的殘渣到結腸後，害菌會使其產生有毒的「氨、胺、亞硝胺、苯酚、甲苯酚」，是腸道腐敗程度的指標（腸子的溫度將近４０度），長時間與腸道接觸會使腸道老化，增加病變的機會。菊糖由於能顯著地抑制害菌的生長，減少毒物的生成。
A：本身含豐富「鈣、鎂、鐵、鋅」，可增進礦物質吸收。
B：菊糖在進入腸道發酵成的「短鏈脂肪酸」。可降低腸道的酸鹼度，增加「可溶鈣」的濃 度，刺激腸道黏膜細胞的增長，使得鈣的吸收速率增加。除了增進礦物質在腸道中的吸收外，也確實能增加骨骼中礦物質的密度。
幫助血中膽固醇的控制，菊糖可以和膽酸、膽鹽結合，把它們排出體外，防止再吸收，能因此降低血中的三酸甘油酯與膽固醇濃度。
菊糖發酵的「丙酸」最具抑制肝臟膽固醇及三酸甘油酯產生的效果。（預防動脈硬化、脂肪肝）
短鏈脂肪酸
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